基因测序技术服务

　　1、常规测序

　　常规测序：采用ABI 3730XL测序仪进行测序，有效读长可达800bp以上/反应

　　样品要求：基因组DNA、PCR扩增产物、菌液、质粒DNA等

　　结果形式：电子邮件发送序列文件

　　完成周期：24-48小时

　　2、二代测序技术服务

　　1)基因组de novo测序：用于获得物种的全基因组序列图谱，同时为后续研究提供参考序列。

　　实验要求：

　　1、客户需提供待测样本及相关信息(组织样品，质量不少于10g;提取的基因组DNA：产量≥100mg，浓度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之间;确保DNA无降解，无污染。DNA可分步提供)。

　　2、客户应提供相应的背景材料，包括：样本描述，预测基因组大小，分析要求等。

　　结果形式：

　　提供项目实验报告和分析报告：实验报告包括简单的操作流程、试剂使用等情况;分析报告包括：基因组survey、组装结果、基因结构分析、重复序列分析、基因功能分析、比较基因组学分析、非编码RNA分析。

　　完成周期：根据基因组复杂程度而定。

　　2)基因组重测序：用于在全基因组范围内进行变异检测(Indel，SNP)、进行群体进化分析、进行遗传图谱构建。

　　实验要求：

　　1、客户需提供待测样本及相关信息(组织样品，质量不少于5g;提取的基因组DNA：产量≥20ug，浓度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之间;确保DNA无降解，无污染。)。

　　2、客户应提供相应的背景材料，包括：样本描述，实验目的，必要的相关实验设计内容，分析要求等。

　　结果形式：

　　提供项目实验报告和分析报告：实验报告包括简单的操作流程、试剂使用等情况;分析报告包括：数据产出统计和评估、Mapping情况统计、SNP/INdel Calling分析、nsSNP-containing基因定位和功能注释、相近物种进化分析等。

　　完成周期：质检合格后40个工作日内完成。

　　3)转录组测序：用于基因表达差异分析(质和量)、发掘新基因、进行RNA编辑分析。

　　实验要求：

　　1、客户需提供待测样本及相关信息(组织样品，质量不少于5g;提取的总RNA：产量≥10ug，浓度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之间;确保RNA无降解，无污染。)。

　　2、客户应提供相应的背景材料，包括：样本描述，实验目的，必要的相关实验设计内容，分析要求等。

　　结果形式：

　　提供项目实验报告和分析报告：实验报告包括简单的操作流程、试剂使用等情况;分析报告包括：对于有参考基因组序列的转录组分析包括：数据产出统计和评估、基因表达差异分析、差异表达基因GO富集分析、KEGG分析、SNP/Indel筛选、新基因查找、剪切位点统计、蛋白网络互作等。对于无参考基因组序列的转录组分析包括：数据产出统计和评估、de novo组装结果、污染检测、基因表达及差异分析、差异表达基因GO富集分析、KEGG分析、基因互作网络分析、新转录本查找与LncRNA预测。

　　完成周期：质检合格后40个工作日内完成(如果增加分析要求，时间顺延)。

　　4)Small RNA测序：用于miRNA表达模式分析、miRNA调控网络和靶点、发掘生物标记物。

　　实验要求：

　　1、客户需提供待测样本及相关信息(组织样品，质量不少于5g;提取的总RNA：产量≥50ug，浓度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之间;小RNA：产量≥20ug，浓度≥200ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之间;确保RNA无降解，无污染。)。

　　2、客户应提供相应的背景材料，包括：样本描述，实验目的，必要的相关实验设计内容，分析要求等。

　　结果形式：

　　提供项目实验报告和分析报告：实验报告包括简单的操作流程、试剂使用等情况;分析报告包括：数据质控、参考序列比对、小RNA分类、rRNA，tRNA，snRNA，repeat sRNA和snoRNA鉴定、靶基因预测、碱基偏好性分析、差异表达分析、GO富集分析、KEGG分析、蛋白互作网络分析。

　　完成周期：质检合格后40个工作日内完成(如果增加分析要求，时间顺延)。

　　5)全外显子组测序：用于经济高效发掘外显子区的致病位点及易感位点，发现稀有突变。

　　实验要求：

　　1、客户需提供待测样本及相关信息(组织样品，质量不少于5g;提取的基因组DNA：产量≥50ug，浓度≥50ng/ul;OD260/280值介于1.8～2.0之间;确保DNA无降解，无污染。)。

　　2、客户应提供相应的背景材料，包括：样本描述，实验目的，必要的相关实验设计内容，分析要求等。

　　结果形式：

　　提供项目实验报告和分析报告：实验报告包括简单的操作流程、试剂使用等情况;分析报告包括：数据质控、与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度、SNP/Indel检测、注释及统计、Somatic SNP/Indel检测、注释及统计。

　　完成周期：质检合格后40个工作日内完成(如果增加分析要求，时间顺延)。

　　6)甲基化测序：用于获得单碱基精确度的全基因组DNA甲基化图谱。

　　实验要求：

　　1、客户需提供待测样本及相关信息(DNA样品总量≥5ug，DNA样品浓度≥152 0173 3840ng/ul)。

　　2、客户应提供相应的背景材料，包括：样本描述，实验目的，必要的相关实验设计内容，分析要求等。

　　结果形式：

　　提供项目实验报告和分析报告：实验报告包括简单的操作流程、试剂使用等情况;分析报告包括：数据质控、参考序列比对、C位点覆盖度统计、全基因组甲基化水平分析、甲基化位点检测、差异甲基化区域分析、比对率统计、测序深度统计、染色体水平甲基化密度分布、不同基因组功能元件甲基化分布、CpG、CHG、CHH甲基化比例统计、功能注释及富集分析等。

　　完成周期：质检合格后40个工作日内完成(如果增加分析要求，时间顺延)。